神经系统病变：颅脑外伤、脑梗塞、脑肿瘤、炎症、变性病、先天畸形等，为应用最早的人体系统，尤其是创伤性颅脑急症诊断中属于常规和首选检查方法，可清楚显示脑挫裂伤、急性脑内血肿、硬膜外及硬膜下血肿、颅面骨骨折、颅内金属异物等，而且比其它任何方法都要敏感。CT诊断急性脑血管疾病如高血压脑出血、蛛网膜下腔出血、脑动脉瘤及动静脉畸形破裂出血、脑梗塞等有很高价值，急性出血可考虑作为首选检查，急性脑梗塞特别是发病6小时内者，CT不如MRI敏感。
心血管系统：可用于心包、心包积液等的诊断，急性主动脉夹层动脉瘤CT有肯定的诊断意义，特别是增强扫描具有特征性表现，并可做定性诊断。
胸部病变：对于显示肺部病变有非常满意的效果，对肺部创伤、感染性病变、肿瘤等均匀有很高的诊断价值。对于纵隔内的肿物、淋巴结以及胸膜病变等可以显示肺内团块与纵隔关系等。
腹部器官：对于实质性器官**、胆囊、**、**、**、肾上腺等器官显示清晰，对于肿瘤、感染及创伤能清晰的显示解剖的准确部位病变程度，对病变分期等有较高价值，有助于临床制定治疗方案，尤其对于手术科室的手术定位有重要意义，对腹内肿块的诊断与鉴别诊断价值较大。
盆腔脏器：盆腔器官之间有丰富的脂肪间隔，能准确地显示肿瘤对邻近组织的侵犯，因此CT已成为卵巢、宫颈和子宫、膀胱、精囊、前列腺和直肠肿瘤诊断，临床分期和放射治疗设计的重要手段。
骨与关节：
（1）骨、肌肉内细小病变，X线平片常被骨皮质遮盖不能显示。
（2）结构复杂的骨、关节，如脊椎、胸锁关节等。
（3）X线可疑病变，如关节面细小骨折、软组织脓肿、髓内骨肿瘤造成的骨皮质破坏，观察肿瘤向软组织浸润的情况等。
（4）对骨破坏区内部及周围结构的显示：如破坏区内的死骨、钙化、骨化以及破坏区周围骨质增生、软组织脓肿、肿物显示明显优于常规X线平片。
（5）对于关节软骨、韧带、半月板、滑膜等则以行MRI检查为宜。
**病变：CT检查对于肝内点位性病变、原发性肝癌或转移性肝癌的形态、轮廓、坏死、出血及生长方式等都可以显示，还可以了解胆、胰、肾等脏器的情况，所以慢性肝炎、肝硬化并存在可疑病变或肝癌的患者，则有做CT检查的必要。
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