清末甲午战争后,列强瓜分中国,民族危机日益加深。1898.6.11,光绪皇帝颁布《明定国是诏》书,支持康有为梁启超变法,通过政治,经济,文教,军事多方面改革,学习西方制度,废科举兴学堂,以救亡图存,实现国家富强。光绪卅一(1905)年,阜阳举人宁继恭任堂长,于今阜阳市南城小学创颍州府立学堂,设蚕桑专业,招收学生近百人,是为阜阳农校前身。多为富家子弟,中途退学者较多。只一期毕业证23人,学制二年私费毕业后自谋出路。学校管理设堂长、鉴定学各1人。办学经费1为地方烟酒费支拨。教师聘自杭州,教材系日本翻译本。

民国七年(1918)五月四日,安省桑蚕讲习所因经费困难,不能扩充。省政府为振兴淮北蚕利,派童帷书(字介魁)于今校东二华里处,创办省立高中第二桑蚕讲习所,设蚕桑专业,学制二年,招收高小毕业生两期三班,学生一百多人,教师十多人,聘自杭州蚕桑学校毕业生。学校管理设校长一人,鉴学二人,。学生自费,毕业后自谋职业,办学经费大部分由学校蚕桑收入解决,不足部分省里拨款补助。

民国十二年安徽省歌育厅改省立第二蚕桑讲习所为安徽省阜阳蚕桑学校,委托童帷书为校长,旋又改为安徽省第五甲种农业职业中学。设农艺、蚕桑二专业,学制农艺四年招收高小毕业生8班320人。其中农艺一期4个班160人,蚕桑二期4个班160人,校长委任制,教师实行聘任制,教职工55人,其中教师30多人,聘自杭州、南京、武汉。学校管理由校长全面负责,设鉴学二人,负责教学、生产、生活。校园占地120亩,校舍130多间,分设教、寝室、自习室、图书、阅览室。实习场地有农业生产地80亩,桑园50亩,并设有蚕制种、饲养、烘丝等设备。

民国廿五年(1923),吕醒环任校长,李家骥任教导主任,省立第五甲种农业学校并入省立第六中学,易名职业科,1924年徐淮任校长,职业科学生毕业,停办。1928年,依照安徽省中等农业改造方案,正式和省立阜阳六中合并。

民国卅年(1944),阜阳专员公署专员张威遐向省府报告,于阜阳城西关外,创办安徽省第三区九县联立临时中学,张威遐任校长,吕醒环任副校长,闫汉生任教导主任。1946年省教育厅令改为第三区九县联立农业职业中学,1946年暑期,迁到阜阳城南九里沟原大同中学旧址。学校设农艺、园艺二专业,招收高小和初中毕业生,学制三年,共招农艺专业四个班160人,其中分高级班和初级班,园艺专业2个班80人。


民国卅六年{1947),省教育厅令改第三区九县联立农业职业中学为省立农业职业中学,方远礼任校长,教师一部分来自南方,一部分请自本地,共30多人,设农艺、园艺两专业,在校学生各4个班,计320人。
民国卅七年(1948)春,阜阳处于解放前夕,学校短期迁到颍上县。八月一日阜阳解放,学校先后迁到临淮关、南京和芜湖。1949年芜湖解放,由军管会介绍到皖北行署,师生安排工作。原校由席家治临时负责,招高职三个班150人,1949年并入皖北行政学院。

在民国卅年间,阜阳农业职业教育,计培养初中级农业技术人才24班890人。